在表示[好]这个含义时两者没有什么区别，但是[いい]比较柔软，适合通常正规的文书，女性口语，或比较有教养的人等一般描述， [よい]大多为男性使用，比较旷感，因此多用于[禁止]，[命令]，[断定]等语态。缺乏柔软感。需要注意的是这个形容词比较特殊，两者的否定式都是[よくない]、或「よくありません」。
另一个需要注意的，也是任何字典上查不到的注意点是[いい]这个词虽然表面含义是[好]，[好的]，但是生活口语中经常用作否定表达，如以下的对话——
留学生：すみませんが、アルバイトを探しているですけど。。。
店員：いい留学生：いいの？
店員：だからいいって。
留学生：（戸惑う表情のまま店を去った）上面的对话中的[いい]的含义楼主明白了吗？
解说——
留学生：第一句试探着打招呼[有人吗，我是来找零工。。]
店员：马上回答道[好了，好了]（这个[好]其实是[算了算了]回绝对方的含义）
留学生：不解又问道[真的可以做吗？]（显然这个留学生把店员的[いい]错误地理解为同意他做工了）
店员有点不耐烦地说[不是说不要了？]（这里他强调了这个[いい]是不要的意思）
这个留学生看来跟现在的楼主差不多，困惑不解地离开了商店，哈哈！类似的用法在酒席上有别人问道[もういっぱいどうですか？（再来一杯如何？）] 「いい。」（这里是[不要]的拒绝含义）「いいよ。」（这是同意给自己继续斟酒的表达。）